مرگ مستنصر باعث انشقاق بزرگ در درون فاطمیان گردید. مستنصر، نزار پسر ارشد خود را به جانشینى خود منصوب کرده بود، ولى افضل (پسر بدر الجمالی وزیر مستنصر) که مى دانست با آمدن نزار از کار برکنار مى شود و یا قدرتش محدود مى شود، کوچکترین فرزند مستنصر را که بیشتر از بیست سال نداشت و به تازگى خواهر افضل را به همسرى گرفته بود، به عنوان امام اسماعیلیه مطرح ساخت و از بزرگان کاخ فاطمیان براى وى بیعت گرفت و به این ترتیب باعث ایجاد دو فرقه بزرگ در اسماعیلیه شد.

مستنصر فرزند الظاهر در سال 427 هـ جانشین او شد اما به خاطر خردسالى وى، جرجرائى وزیر دربار همه کاره بود. بعد از او مادر مستنصر نایب السلطنه شد و به علت روابط نزدیکش با یهود، آنان را به وزارت رسانید که باعث هرج و مرج و قحطی بسیار در کشور شد و در مدت ده سال، چهل وزیر کارها را به دست گرفتند و اکثراً به قتل رسیدند. تا اینکه بدرالجمالى ارمنی توانست نظم را به مصر بازگرداند و بعد از بیست سال وزارت از دنیا رفت و پسرش افضل جانشین او شد. مستنصر نیز همان سال از دنیا رفت.