ادعای محدث نوری در کتاب «فصل الخطاب» توسط علمایی چون علامه شهرستانی، علامه بلاغی، آیت الله خویی، معرب تهرانی و... در کتاب هایی چون کشف الارتیاب عن تحریف الکتاب، حفظ الكتاب الشريف عن شبهة القول بالتحريف، آلاءالرحمن، البیان و... مورد ابطال و نقد قرار گرفته اند. به طور کلی کتاب «فصل الخطاب» به محض انتشار، به شدت از سوی بسیاری از علمای شیعه مورد تندترین نقدها قرار گرفت و هیچ گاه مطالب آن نتوانست نفوذ و اعتباری نزد جامعه شیعی پیدا کند.

«صحیفه النّبی»، «صحیفه علی»، «کتاب علی»، «کتاب نبی» و یا «الجامعه» همه مصداق یک چیز هستند و با «مصحف علی» تفاوت اساسی دارد؛ زیرا مراد از «صحیفه» و یا «الجامعه» مجموعه ای از احادیث است که منشاء بسیاری از احکام و یک کتاب فقهی و حقوقی می باشد. امّا «مصحف علی(ع)» همان قرآن به کتابت علی(ع) می باشد که از نظر تعداد آیات و سوره ها همانند قرآن موجود در میان مسلمین می باشد، مگر اینکه بر اساس ترتیب نزول تنظیم شده و مشتمل بر تفسیر، تاویل، و توضیحاتی است که در فهم قرآن تأثير به سزايى دارد.