کتابهای قانونی ثانوی، در کتاب مقدس کاتولیک و ارتودکس وجود دارد، ولی یهودیان و بیشتر فرقه های پروتستان آنها را قبول ندارند. موضوع بیشتر این کتابها، اخلاق، حکمت، و توصیه به رعایت تقوی و صدق و درستکاری می باشد.

اختلاف کلیسای ارتدوکس شرق و کاتولیک رومی از تقسیم بندی جغرافیایی و موضوع کوچک هم رتبه بودن اسقف اورشلیم و اسقف روم آغاز شد، اما کم کم به برخی مسائل اعتقادی و آموزه های مذهبی کشیده شد، مانند: 1- صدور روح القدس از پدر یا از پدر و پسر. 2- عصمت پاپ و مقامات کلیسایی. 3- مسئله تجرد مقامات روحانی. 4- باکره بودن حضرت مریم(س) تا پایان عمر. 5- منابع و مآخذ اصول اعتقادی. 6- مسئله فدیه. 7- اجرای رسوم هفتگانه.